O Programa Terra a Limpo prevê ações em 88 municípios que integram o Bioma Amazônia e entorno, envolvendo Glebas e Assentamentos Estadual e Federal, sob gestão do Intermat e do Incra.
Relação do Municípios abrangentes: Alta Floresta, Alto Boa Vista, Alto Paraguai, Apiacás, Araputanga, Arenápolis, Aripuanã, Barra do Bugres, Bom Jesus do Araguaia, Brasnorte, Cáceres, Campinápolis, Canabrava do Norte, Canarana, Carlinda, Castanheira, Cláudia, Cocalinho, Colíder, Colniza, Comodoro, Confresa, Conquista D'Oeste, Cotriguaçu, Curvelândia, Denise, Diamantino, Feliz Natal, Figueirópolis D'Oeste, Gaúcha do Norte, Glória d'Oeste, Guarantã do Norte, Ipiranga do Norte, Jaurú, Juara, Juína, Juruena, Lambari D'Oeste, Luciara, Marcelândia, Matupá, Mirassol do Oeste, Nortelândia, Nova Bandeirantes, Nova Canaã do Norte, Nova Guarita, Nova Lacerda, Nova Marilandia, Nova Maringá, Nova Monte Verde, Nova Mutum, Nova Olímpia, Nova Ubiratã, Novo Horizonte do Norte, Novo Mundo, Novo Santo Antônio, Paranaíta, Paranatinga, Peixoto de Azevedo, Pontes e Lacerda, Porto Alegre do Norte, Porto dos Gaúchos, Porto Esperidião, Porto Estrela, Querência, Reserva do Cabaçal, Ribeirão Cascalheira, Rio Branco, Rondolândia, Rosario Oeste, Salto do Céu, Santa Carmem, Santa Terezinha, Santo Afonso, São Félix do Araguaia, São José do Rio Claro, São José do Xingú, São José dos Quatro Marcos, Serra Nova Dourada, Sorriso, Tabaporã, Tangará da Serra, Tapurah, Terra Nova do Norte, União do Sul, Vera, Vila Bela da Santíssima Trindade, Vila Rica.
Saliente-se que dos Municípios relacionados, 79 integram o Bioma Amazônia Conforme Portaria MMA 96, de 27/03/2008 (https://www.normasbrasil.com.br/norma/portaria-96-2008_205801.html). O entorno é composto de 9 Municípios: Cáceres, Campinápolis, Cocalinho, Luciara, Nova Mutum, Novo Santo Antônio, Porto Estrela, Rosário Oeste, Serra Nova Dourada.